Par Julie Steenhuysen
CHICAGO (Reuters) – La variante hautement transmissible Omicron du virus SARS-CoV-2 – dont la forme la plus courante est connue sous le nom de BA.1 – représente désormais presque toutes les infections à coronavirus dans le monde, bien que des augmentations spectaculaires des cas de COVID aient déjà culminé dans certains pays.
Les scientifiques suivent maintenant une augmentation des cas causés par un cousin proche connu sous le nom de BA.2, qui commence à supplanter BA.1 dans certaines parties de l’Europe et de l’Asie. Voici ce que nous savons jusqu’à présent sur la nouvelle sous-variante :
SOUS-VARIANTE « STEALTH »
À l’échelle mondiale, BA.1 représentait 98,8% des cas séquencés soumis à la base de données publique de suivi des virus GISAID au 25 janvier. Mais plusieurs pays signalent des augmentations récentes de la sous-variante connue sous le nom de BA.2, selon l’Organisation mondiale de la santé.
En plus de BA.1 et BA.2, l’OMS répertorie deux autres sous-variantes sous l’égide d’Omicron : BA.1.1.529 et BA.3. Tous sont étroitement liés génétiquement, mais chacun présente des mutations qui pourraient modifier leur comportement.
Trevor Bedford, un virologue informatique au Fred Hutchinson Cancer Center qui a suivi l’évolution du SRAS-CoV-2, a écrit sur Twitter vendredi que BA.2 représente environ 82% des cas au Danemark, 9% au Royaume-Uni et 8% aux États-Unis, sur la base de son analyse des données de séquençage de la base de données GISAID et du nombre de cas du projet Our World in Data de l’Université d’Oxford.
La version BA.1 d’Omicron a été un peu plus facile à suivre que les variantes précédentes. En effet, il manque à BA.1 l’un des trois gènes cibles utilisés dans un test PCR courant. Les cas montrant ce modèle ont été supposés par défaut être causés par BA.1.
BA.2, parfois connu sous le nom de sous-variant « furtif », n’a pas le même gène cible manquant. Au lieu de cela, les scientifiques le surveillent de la même manière qu’ils ont des variantes antérieures, y compris Delta, en suivant le nombre de génomes de virus soumis à des bases de données publiques telles que GISAID.
Comme pour les autres variantes, une infection par BA.2 peut être détectée par des kits de test à domicile de coronavirus, bien qu’ils ne puissent pas indiquer quelle variante est responsable, ont déclaré des experts.
PLUS TRANSMISSIBLE ?
Certains premiers rapports indiquent que le BA.2 pourrait être encore plus infectieux que le BA.1 déjà extrêmement contagieux, mais rien ne prouve jusqu’à présent qu’il soit plus susceptible d’échapper à la protection vaccinale.
Les autorités sanitaires danoises estiment que BA.2 peut être 1,5 fois plus transmissible que BA.1, sur la base de données préliminaires, bien qu’il ne provoque probablement pas de maladie plus grave.
En Angleterre, une analyse préliminaire de la recherche des contacts du 27 décembre 2021 au 11 janvier 2022 par la UK Health Security Agency (HSA) suggère que la transmission domestique est plus élevée parmi les contacts des personnes infectées par BA.2 (13,4 % ) par rapport aux autres cas Omicron (10,3 %).
La HSA n’a trouvé aucune preuve d’une différence dans l’efficacité du vaccin, selon le rapport du 28 janvier.
Une question cruciale est de savoir si les personnes infectées lors de la vague BA.1 seront protégées contre BA.2, a déclaré le Dr Egon Ozer, expert en maladies infectieuses à la Northwestern University Feinberg School of Medicine de Chicago.
Cela a été une préoccupation au Danemark, où certains endroits qui ont vu un nombre élevé de cas d’infections à BA.1 signalaient une augmentation des cas de BA.2, a déclaré Ozer.
Si une infection antérieure par BA.1 ne protège pas contre BA.2, « cela pourrait être une sorte de vague de chameau à deux bosses », a déclaré Ozer. « Il est trop tôt pour savoir si cela se produira. »
La bonne nouvelle, a-t-il dit, est que les vaccins et les rappels « empêchent toujours les gens d’aller à l’hôpital et empêchent les gens de mourir ».
(Reportage par Julie Steenhuysen; Montage par Bill Berkrot)
